В лаборатории фармакогеномики ИХБФМ СО РАН разработан прототип портативной тест-системы для оперативного выявления коронавируса SARS-CoV-2. В ходе теста выявляется наличие/отсутствие в биоматериале человека генетического материала вируса.
В основе работы тест-системы – метод изотермической амплификации ДНК, чувствительность и надёжность которого выше, чем у традиционной ПЦР. Кроме этого тестирование выполняется при постоянной температуре 60-65оС, что может быть реализовано даже с использованием банки, чайника и термометра без дорогостоящего оборудования. Результат можно определить как визуально, по изменению цвета раствора в пробирке, так и с использованием карманного переносного флюориметра.
Для проведения анализа с помощью разработанной методики у человека берется мазок из носа или со стенки глотки, из взятого биоматериала выделяется РНК с помощью упрощенного экспресс-метода. Далее 40 минут необходимо для высокочувствительного (до 5 копий генома вируса на реакцию) выявления генетического материала вируса SARS-CoV-2. Весь процесс занимает не более 1,5 часов, для его осуществления не требуется сложное дорогостоящее оборудование. В перспективе методика может быть использована для экспресс-диагностики вне стен специализированных лабораторий, например, прямо в терминале аэропорта. В настоящий момент коллектив разработчиков работает над автоматизацией процесса анализа, объединяя все необходимые процессы после взятия мазка слизистой носоглотки в единое одноразовое микроустройство. Разрабатываемая технология может быть в дальнейшем адаптирована к более привычным (но не менее неприятным) для нас вирусам. Например для диагностики вируса гриппа.
Описываемая работа является классическим примером трансляции ранее выполненных фундаментальных научных исследований в практику. Сердцем предложенной тест системы являются ранее описанные в престижном научном журнале Nucleic Acids Research ферменты, способные амплифицировать нуклеиновые кислоты при постоянной температуре из сложных не очень хорошо очищенных смесей (Oscorbin et al., 2017).