• Проведен комплекс исследований факторов, влияющих на субстратную специфичность фермента Fpg и OGG1. Часто возникающее в геноме поврежденное основание 8-оксогуанин (oxoG) стимулирует мутагенное включение dAMP при репликации. При репарации oxoG ферментами Fpg бактерий и OGG1 человека для предотвращения мутагенеза oxoG должен удаляться из пар oxoG:C, но не из пар oxoG:A. Установлены механизмы действия этих ферментов, основные параметры строения ДНК, влияющие на их активность, определены аминокислотные остатки, критичные для их функционирования. [Kirpota et al., Nucleic Acids Res. 2011. 39, 4836; Popov et al., J. Comput. Chem. 2013. 34, 319].
• Проведен комплекс исследований ферментов NEIL1 и NEIL2 человека – гомологов белков Escherichia coli формамидопиримидин-ДНК-гликозилазы (Fpg) и эндонуклеазы VIII (Nei). Установлен подробный механизм узнавания поврежденных оснований ферментами этого класса. Показано, что NEIL1 вместе с 8-оксогуанин-ДНК-гликозилазой человека (OGG1) отвечает за репарацию поврежденного основания 8-оксоаденина в ДНК. Установлены участки белка NEIL2, ответственные за связывание с ДНК. [Grin et al., FEBS Lett. 2010. 584, 1553; Grin et al., Biochem. Biophys. Res. Commun. 2010. 394, 100; Kuznetsov et al., DNA Repair. 2012. 11, 884].
• Поиск специфических участков в ДНК может идти по трем основным механизмам: ненаправленной трехмерной диффузии (дистрибутивный поиск), ненаправленной одномерной диффузии (процессивный поиск) и АТФ-зависимой направленной транслокации. Разработан новый метод, позволяющий количественно охарактеризовать процессивный поиск, в том числе оценить вклад в него разных механизмов транслокации. Метод использован для установления механизма поиска повреждений урацил-ДНК-гликозилазами и апурин-апиримидиновыми эндонуклеазами человека и E. coli. Показано, что эти ферменты способны вести коррелированный поиск при низкой ионной силе и переходить на дистрибутивную модель при ее повышении, количественно охарактеризован механизм поиска. [Zharkov et al., Mutat. Res. 2010. 685, 11; Mechetin & Zharkov, Biochem. Biophys. Res. Commun. 2011; Мечетин, Жарков, ДАН. 2011. 437, 695].
• Исследована роль репарации ДНК в разрастании тринуклеотидных повторов и в регуляции статуса эпигенетического метилирования ДНК – процессов, связанных с нейродегенеративными и онкологическими заболеваниями. Установлены закономерности эффективности репарации внутри трактов тринуклеотидных повторов. Показана роль ДНК-гликозилазы MBD4 в активном деметилировании CpG-островков в ДНК. [Деревянко и др., Биохимия. 2012. 77, 342; Morera et al., Nucleic Acids Res. 2012. 40, 9917].

Базовые проекты

• Программа фундаментальных научных исследований, № 12103130056-8 «Поиск, дизайн и валидация новых белков как фармакологических мишеней и инструментов для генетических технологий» (2021-2024)

Гранты Российского научного фонда

• № 21-64-00017 «Модификация нуклеиновых кислот и репарация ДНК как источник новых инструментов управления геномами» (2021-2024)
• № 21-74-10104 «Биоортогональность в свете защитных механизмов клетки: взаимодействие неприродных нуклеиновых кислот с системой эксцизионной репарации оснований ДНК» (2021-2024)
• № 23-44-00050 «Репарация ДНК как фактор устойчивости растений к солевому и температурному стрессу: модель сахарной свеклы» (2023-2025)
• № 23-74-10040 «Точность действия ДНК-полимераз на поврежденных и неповрежденных ДНК-матрицах при синтезе с вытеснением цепи» (2023-2026)
• № 24-14-00285 «Регуляторные функции окислительных повреждений ДНК в экспрессии генов» (2024-2026)

Министерство науки и высшего образования РФ

• № 2021-646-ФП5-0002-013 «Реализация на уникальной научной установке Станция EXAFS спектроскопии научных исследований мирового уровня в области фундаментальной медицины» (2022-2024)

1. Thymines opposite to bulky aristolactam-DNA adducts in duplex DNA are not targeted by human thymine-DNA glycosylase. Manapkyzy D., Zhamanbayeva G., Sidorenko V.S., Bonala R., Johnson F., Matkarimov B.T., Zharkov D.O., Saparbaev M.K., Taipakova S. PeerJ 2025. V. 13. e19577. DOI: 10.7717/peerj.19577
2. TBEV NS1 Induces Tissue-Specific Microvascular Endothelial Cell Permeability by Activating the TNF-α Signaling Pathway. Khlusevich Y. , Kravchuk B. , Kechin A. , Stepanova A. , Emelyanova L. , Khachatryan S., Tikunova N. , Matveev A. International Journal of Molecular Sciences. 2025. V.26. N11. 5311. DOI: 10.3390/ijms26115311
3. Platinum polyoxoniobate: Stability, cytotoxicity and cellular uptake. Yudkina A.V., Vokhtantsev I.P., Rychkov D.A., Volchek V.V., Abramov P.A., Sokolov M.N., Zharkov D.O. Russian Journal of Bioorganic Chemistry. 2025. V. 51. N 2. P. 693-701. DOI: 10.1134/S1068162024606141 перевод
4. Полиоксониобат платины: стабильность, цитотоксичность и поглощение клетками. Юдкина А.В., Вохтанцев И.П., Рычков Д.А., Волчек В.В., Абрамов П.А., Соколов М.Н., Жарков Д.О. Биоорганическая химия. 2025. Т. 51. № 2 С. 362-372. DOI: 10.31857/S0132342325020141
5. Developing plant-derived DNA repair enzyme resourcesthrough studying the involvement of base excision repair DNA glycosylases in stress responses of plants (обзор). Zhao Y, Chen D., Грин И.Р., Жарков Д.О., Yu B. Physiol. Plant. 2025. P. 1-12. DOI: 10.1111/ppl.70162
6. Design of theophylline binding guide RNA for allosteric regulation of CRISPR/Cas9 system. Dolzhikova O., Meschaninova M.I., Endutkin A.V., Golyshev V.M., Vorobyeva M.A., Novopashina D.S. 2025. DOI: 10.20944/preprints202412.0134.v1 препринт
7. Polyamine adducts with AP sites: Interaction with DNA polymerases and AP endonucleases. Yudkina A.V., Amanova M.M., Zharkov D.O. Chem. Res. Toxicol. 2025. V. 38. N 1. P. 102-114 DOI: DOI: 10.1021/acs.chemrestox.4c00312
8. Position-dependent effect of AP sites within an hTERT promoter G-quadruplex scaffold on quadruplex stability and repair activity of the APE1 enzyme. Savitskaya V.Y., Novoselov K.A., Dolinnaya N.G., Monakhova M.V., Snyga V.G., Diatlova E., Peskovatskova E.S., Golyshev V.M., Kitaeva M.I., Eroshenko D.A., Zvereva M.I., Zharkov D.O., Kubareva E.A. Int. J. Mol. Sci. 2025. V. 26. N 1. P. 337. DOI: 10.3390/ijms26010337
9. Bypass of methoxyamine-adducted abasic sites by eukaryotic translesion DNA polymerases. Yudkina A.V., Novikova A.A., Stolyarenko A.D., Makarova A.V., Zharkov D.O. Int. J. Mol. Sci. 2025. V. 26. P. 642. DOI: 10.3390/ijms26020642
10. The hidden elephant: Modified abasic sites and their consequences. Yudkina A.V., Zharkov D.O. DNA Repair. 2025. V. 148. P. 103823. DOI: 10.1016/j.dnarep.2025.103823
11. The effect of methylation and hydroxymethylation of cytosine on activity and fidelity of Pol λ and Pol β. Shilkin E.S., Petrova D.V., Kruchinin A.A., Zharkov D.O., Makarova A.V. DNA Repair. 2025. V. 148. P. 103815. DOI: 10.1016/j.dnarep.2025.103815
12. Genome-wide analysis of Ca2+ ATPases and their salt stress responses in sugar beet. Liu S., Chen S., Grin I.R., DuanMu H., Li H. Sugar Tech. 2025. V. 27. N 2. P. 488-505. DOI: 10.1007/s12355-024-01518-6
13. Developing plant-derived DNA repair enzyme resources through studying the involvement of base excision repair DNA glycosylases in stress response. Zhao Y., Chen D., Grin I.R., Zharkov D.O., Yu B. Physiol. Plant. 2025. V. 177. N 2. e70162. DOI: 10.1111/ppl.70162
14. A non-canonical nucleotide from viral genomes interferes with the oxidative DNA damage repair system. Yudkina A.V., Endutkin A.V., Diatlova E., Zharkov D.O. DNA Repair. 2024. V. 133. P. 103605. DOI: 10.1016/j.dnarep.2023.103605
15. Стратегии расщепления N-гликозидной связи ферментами репарации ДНК. Ендуткин А.В., Жарков Д.О. Вестник Московского университета. Серия 2. Химия. 2024. Т. 65. № 2. С. 136-143. DOI: 10.55959/MSU0579-9384-2-2024-65-2-136-14
16. 8-Oxoadenine: A «New» Player of the Oxidative Stress in Mammals? Kruchinin A.A., Kamzeeva P.N., Zharkov D.O., Aralov A.V., Makarova A.V. Int. J. Mol. Sci. 2024. V. 25. N 2. P. 1342. DOI: 10.3390/ijms25021342
17. Фоторасщепляемые направляющие РНК для фоторегулируемой системы CRISPR/Cas9. Ахметова Е.А., Вохтанцев И.П., Мещанинова М.И., Воробьева М.А., Жарков Д.О., Новопашина Д.С. Биоорганическая химия. 2024. Т. 50. № 4. С. 556–567. DOI: 10.31857/S0132342324040107
18. Back-up base excision DNA repair in human cells deficient in the major AP endonuclease, APE1. Kim D.V., Diatlova E., Zharkov T.D., Melentyev V.S., Yudkina A.V., Endutkin A.V., Zharkov D.O. Int. J. Mol. Sci. 2024. V. 25. N 1. ю 64. DOI: 10.3390/ijms25010064
19. Sensing of DNA modifications by pAgo proteins in vitro. Beskrovnaya M., Agapov A., Makasheva K., Zharkov D.O., Esyunina D., Kulbachinskiy A. Biochimie. 2024. V. 220. P. 39-47. DOI: 10.1016/j.biochi.2023.12.006
20. Characterizing Aptamer Interaction with the Oncolytic Virus VV-GMCSF-Lact. Dymova M.A., Malysheva D.O., Popova V.K., Dmitrienko E.V., Endutkin A.V., Drokov D.V., Mukhanov V.S., Byvakina A.A., Kochneva G.V., Artyushenko P.V., Shchugoreva I.A., Rogova A.V., Tomilin F.N., Kichkailo A.S., Richter V.A., Kuligina E.V. Molecules. 2024. V. 29. P. 848. DOI: 10.3390/molecules29040848
21. Repair and DNA Polymerase Bypass of Clickable Pyrimidine Nucleotides. Endutkin A.V., Yudkina A.V., Zharkov T.D., Barmatov A.E., Petrova D.V., Kim D.V., Zharkov D.O. Biomolecules. 2024. V. 14. N 6. P. 681. DOI: 10.3390/biom14060681
22. Probing the Conformational Restraints of DNA Damage Recognition with β-L-Nucleotides. Yudkina A.V., Kim D.V., Zharkov T.D., Zharkov D.O., Endutkin A.V. Int. J. Mol. Sci. 2024. V. 25. N.11. P. 6006. DOI: 10.3390/ijms25116006
23. Как писать и переписывать партитуру ДНК. Жарков Д.О. Наука из первых рук. 2024. № 3/4. С. 100-109.
24. Methylation and hydroxymethylation of cytosine alter efficiency of activity and fidelity of translesion DNA polymerases. Shilkin E.S., Petrova D.V., Novikova A.A., Boldinova E.O., Zharkov D.O., Makarova A.V. DNA Repair. 2024. V. 141. P. 103712. DOI: 10.1016/j.dnarep.2024.103712
25. Фоторегулируемые на уровне направляющей РНК системы CRISPR/CAS. Саковина Л.В., Горленко Е.С., Новопашина Д.С. Биофизика. 2024. Т. 69. № 3. С. 421-431. 10.31857/S0006302924030012
26. Photocleavable Guide RNA for Photocontrolled CRISPR/Cas9 System. Akhmetova E.A., Vokhtantsev I.P., Meschaninova M.I., Vorobyeva M.A., Zharkov D.O., Novopashina D.S. Биоорганическая химия. 2024. V. 50. N 4. P. 1314–1324. DOI: 10.1134/S1068162024040046 перевод
27. Аберрантная репарация 8-оксогуанина в коротких выпетливаниях ДНК. Ерошенко Д.А., Дятлова Е.А., Голышев В.М., Ендуткин А.В., Жарков Д.О. Доклады Академии Наук (науки о жизни). 2024. т. 515. № 2. С. 14–18. DOI: 10.31857/S2686738924020031
28. Aberrant repair of 8-oxoguanine in short DNA bulges. Eroshenko D.A., Diatlova E., Golyshev V.M., Endutkin A.V., Zharkov D.O. Доклады Академии Наук (науки о жизни). 2024. V. 513. Suppl. 1. P. S82–S86. DOI: 10.1134/S1607672923600355 перевод
29. Error-Prone DNA Synthesis on Click-Ligated Templates. Endutkin A.V., Yakovlev A.V., Zharkov T.D., Golyshev V.M., Yudkina A.V., Zharkov D.O. Doklady Biochemistry and Biophysics. 2024. . P. 1-6. DOI: 10.1134/s1607672924600416 перевод
30. An Approach to the Synthesis of Cyclic Photocleavable RNA for Photoactivatable CRISPR/Cas9 System. Ivanskaya E.V., Meschaninova M.I., Vorobyeva M.A., Zharkov D.O., Novopashina D.S. Russ. J. Bioorganic Chem. 2024. V. 50. N 5. P. 1807–1821. DOI: 10.1134/S1068162024050327 перевод
31. Enhanced thermal stability enables human mismatch-specific thymine–DNA glycosylase to catalyse futile DNA repair. Manapkyzy D., Joldybayeva B., Ishchenko, A.A., Matkarimov B.T., Zharkov D.O., Taipakova S., Saparbaev M.K. PloS ONE. 2024. V. 19. N 10. P. e0304818. DOI: 10.1371/journal.pone.0304818
32. Подход к получению циклических фоторасщепляемых РНК для фотоактивируемой системы CRISPR/Cas9. Иванская Е.В., Мещанинова М.И., Воробьева М.А., Жарков Д.О., Новопашина Д.С. Биоорганическая химия. 2024. Т. 50. № 5. С. 619–632. DOI: 10.31857/S0132342324050051
33. Photocleavable Guide crRNAs for a Light-Controllable CRISPR/Cas9 System. Sakovina L.V., Vokhtantsev I.P., Akhmetova E.A., Vorobyeva M.A., Vorobyev P.E., Zharkov D.O., Novopashina D.S. Int. J. Mol. Sci. 2024. V. 25. N 22. P. 12392. DOI: 10.3390/ijms252212392
34. The dual role of methylglyoxal in plant stress response and regulation of DJ-1 protein. Sun Y., Chen S., Grin I.R., Zharkov D.O., Yu B., Li H. Physiol. Plant. 2024. V. 176. N 6. e14608. DOI: 10.1111/ppl.14608
35. Высокоошибочный синтез ДНК на клик-лигированных матрицах. Ендуткин А.В., Яковлев А.О., Жарков Т.Д., Голышев В.М., Юдкина А.В., Жарков Д.О. Доклады Академии Наук (науки о жизни). 2024. Т. 518. № 5. С. 101–107. DOI: 10.31857/S2686738924050186
36. CRISPR/Cas System Photocontrolled at the Guide RNA Leve. Sakovina L.V., Gorlenko E.S., Novopashina D.S. Биофизика. 2024. V. 69. N 3. P. 349–358. DOI: 10.1134/S000635092470043X перевод
37. Биокатализ: современные проблемы и приложения. Варфоломеев С.Д., Швядас В.К., Ефременко Е.Н., Егоров А.М., Хренова М.Г., Тишков В.И., Атрошенко Д.Л., Пометун А.А., Савин С.С., Угарова Н.Н., Ломакина Г.Ю., Гачок И.В., Лягин И.В., Муронец В.И., Синицын А.П., Синицына О.А., Рожкова А.М., Махаева Г.Ф., Бачурин С.О., Лаврик О.И., Жарков Д.О., Юдкина А.В., Панасенко О.М., Байков А.А., Массон П., Паширова Т.Н. Шайхутдинова З.М., Попова Е.В., Тихомирова В.Е., Костa О.А., Кудряшова Е.В., Добрякова, Н.В., Клячко Н.Л., Веселова М.М., Лопуховa А.В., Ле-Дейгенa И.М., Усвалиевa А.Д., Чудосай Ю.В., Еремеевa Н.Л., Зверева М.Э., Рубцова М.Ю., Уляшова М.М., Преснова Г.В., Сиголаева Л.В., Пергушов Д.В., Курочкин И.Н., Евтушенко Е.Г., Богинская И.А., Звягина Ю.Ю., Слипченко Е.А., Крюкова О.В., Седова М.В., Рыжиков И.А., Шумянцева В.В., Королёва П.И., Булко Т.В., Агафонова Л.Е., Масамрех Р.А., Филиппова Т.А., Кузиков А.В., Савицкий А.П., Шлеева М.О., Соловьев И.Д., Марынич Н.К. Успехи химии. 2024. Т. 93. № 12. RCR5144. DOI: 10.59761/RCR5144
38. Факторы, влияющие на стабильность тримерной формы 2′-дезоксиуридин-5′-трифосфатнуклеотидгидролазы Escherichia coli. Юдкина А.В., Коваленко Е.А., Ендуткин А.В., Панферова Е.П., Кириленко А.А., Коханенко А.А., Жарков Д.О. Молекулярная биология. 2023. Т. 57. № 2. С. 330-339. DOI: 10.31857/S0026898423020246
39. Механизмы специфичности системы CRISPR/Cas9 в геномном редактировании. Кулишова Л.М., Вохтанцев И.П., Ким Д.В., Жарков Д.О. Молекулярная биология. 2023. Т. 57. № 2. C. 269-284. DOI: 10.31857/S0026898423020155
40. Dynamics of 8-oxoguanine in DNA: Decisive effects of base pairing and nucleotide context. Ovcherenko S.S., Shernyukov A.V., Nasonov D.M., Endutkin A.V., Zharkov D.O., Bagryanskaya E.G. Journal of the American Chemical Society. 2023. V. 145. N 10. P. 5613-5617. DOI: 10.1021/jacs.2c11230
41. Активность экзонуклеазы nsp14 вируса SARS-CoV-2 по отношению к РНК с модифицированными 3′-концевыми нуклеотидами. Ююкина С.К., Барматов А.Е., Бизяев С.Н., Стеценко Д.А., Сергеева О.В., Зацепин Т.С., Жарков Д.О. Доклады Российской Академии Наук. 2023. Т. 509. № 1. С. 196-201. DOI: 10.31857/S268673892370018X
42. Pan-cancer antagonistic inhibition pattern of ATM-driven G2/M checkpoint pathway vs other DNA repair pathways. Zolotovskaia M.A., Modestov A., Suntsova M.V., Rachkova A., Koroleva E.V., Poddubskaya E.V., Sekacheva M.I., Tkachev V.S., Garazha A., Glusker A.A., Seryakov A., Vladimirova U., Rumiantsev P., Moisseev A., Zharkov D.O., Kuzmin D.V., Wang Y., Prassolov V., Shegay P.V., Li X., Steinbichler T.B., Kim E., Sorokin M., Buzdin A.B. DNA Repair. 2023. V. 123. P. 103448. DOI: 10.1016/j.dnarep.2023.103448
43. DNA damage response and repair in boron–neutron capture therapy. Mechetin G.V., Zharkov D.O. Genes. 2023. V. 12. N 1. P. 127. DOI: 10.3390/genes14010127
44. Альтернативные механизмы мутагенеза в mCpG сайтах при репликации и репарации. Шилкин Е.С., Петрова Д.В., Жарков Д.О., Макарова А.В. Молекулярная биология. 2023. Т. 57. № 4. С. 587-596. DOI: 10.31857/S0026898423040195
45. Abasic site–peptide cross-links are blocking lesions repaired by AP endonucleases. Yudkina A.V., Bulgakov N., Kim D.V., Baranova S.V., Ishchenko A.A., Saparbaev M.K., Koval V.V., Zharkov D.O. Nucleic Acids Res. 2023. V. 51. N 12. P. 6321-6336. DOI: 10.1093/nar/gkad423
46. Correlated target search by vaccinia virus uracil–DNA glycosylase, a DNA repair enzyme and a processivity factor of viral replication machinery. Diatlova E., Mechetin G.V., Yudkina A.V., Zharkov D.O., Torgasheva N.A., Endutkin A.V., Shulenina O.V., Konevega A.L., Gileva I.P., Shchelkunov S.N., Zharkov D.O. Int. J. Mol. Sci. 2023. V. 24. N 11. P. 9113. DOI: 10.3390/ijms24119113
47. Activity of nsp14 exonuclease from SARS-CoV-2 towards RNAs with modified 3′-termini. Yuyukina S.K., Barmatov A.E., Bizyaev S.N., Stetsenko D.A., Sergeeva O.V., Zatsepin T.S., Zharkov D.O. Доклады Российской Академии Наук. 2023. V. 509. N 1. P. 65–69. DOI: 10.1134/S1607672923700102 перевод
48. Genome-wide analysis of WD40 protein family and functional characterization of BvWD40-82 in sugar beet. Wu Z., Zhang T., Li J., Chen S., Grin I.R., Zharkov D.O., Yu B., Li H. Front. Plant Sci. 2023. V. 14. P. 1185440. DOI: 10.3389/fpls.2023.1185440
49. Bypass of abasic site–peptide cross-links by human repair and translesion DNA polymerases. Yudkina A.V., Barmatov A.E., Bulgakov N., Boldinova E.O., Shilkin E.S., Makarova A.V., Zharkov D.O. Int. J. Mol. Sci. 2023. V. 24. N 13. P. 10877. DOI: 10.3390/ijms241310877
50. Долголетие: от фантазий к технологиям продления здоровой жизни. Власов В.В., Жарков Д.О. Наука из первых рук. 2023. № 1 (96). С. 6-41.
51. Base excision DNA repair in plants: Arabidopsis and beyond. Grin I.R., Petrova D.V., Endutkin A.V., Chunquan M., Bing Y., Haiying L., Zharkov D.O. Int. J. Mol. Sci. 2023. V. 24. N 19. P. 14746. DOI: 10.3390/ijms241914746
52. Cas9 is mostly orthogonal to human systems of DNA break sensing and repair. Maltseva E.A., Vasil’eva I.A., Moor N.A., Kim D.V., Dyrkheeva N.S., Kutuzov M.M., Vokhtantsev I.P., Kulishova L.M., Zharkov D.O., Lavrik O.I. PloS ONE. 2023. V. 18. N 11. e0294683. DOI: 10.1371/journal.pone.0294683
53. Mechanisms of the specificity of the CRISPR/Cas9 system in genome editing. Kulishova L.M., Vokhtantsev I.P., Kim D.V., Zharkov D.O. Молекулярная биология. 2023. V. 57. N 2. P. 258–271. DOI: 10.1134/S0026893323020139 перевод
54. Factors affecting the stability of the trimer of 2′-deoxyuridine 5′-triphosphate nucleotide hydrolase from Escherichia coli. Yudkina A.V., Kovalenko E.A., Endutkin A.V., Panferova E.P., Kirilenko A.A., Kokhanenko A.A., Zharkov D.O. Молекулярная биология. 2023. V. 57. N 2. P. 312–319. DOI: 10.1134/S002689332302022X перевод
55. Alternative mechanisms of mutagenesis at mCpG sites during replication and repair. Shilkin E.S., Petrova D.V., Zharkov D.O., Makarova A.V. Молекулярная биология. 2023. V. 57. N 4. P. 584–592. DOI: 10.1134/S0026893323040155 перевод
56. Особенности ответа клеток карциномы легких человека A549 с нокаутированным геном PRIMPOL на генотоксический стресс. Громова А.С., Болдинова Е.О., Ким Д.В., Чупров-Неточин Р. Н., Леонов С.В., Пустовалова М.В., Жарков Д.О., Макарова А.В. Биохимия. 2023. Т. 88. № 11. С 2340-2352. DOI: 10.31857/S0320972523110222
57. DNA damage processing by human 8-oxoguanine-DNA glycosylase mutants with substituted Ser-326. Lukina M.V., Zharkov D.O., Koval V.V. Febs Open Bio. 2023. V. 13. S. 2. P. 180. DOI: 10.1002/2211-5463.13646 тезисы конференции
58. «Секрет продления жизни в том, чтобы ее не укорачивать». Власов В.В., Жарков Д.О., Власов В.В. Наука из первых рук. 2023. № 4 (98). С. 6-29.
59. Response of PRIMPOL-Knockout Human Lung Adenocarcinoma A549 Cells to Genotoxic Stress. Gromova A.S., Boldinova E.O., Kim D.V., Chuprov‐Netochin R.N., Leonov S., Pustovalova M., Zharkov D.O., Makarova A.V. Biochemistry (Moscow). 2023. V. 88. N 11. P. 1933–1943. DOI: 10.1134/s0006297923110214 перевод

1.РЕКОМБИНАНТНЫЙ ШТАММ БАКТЕРИЙ ESCHERICHIA COLI ROSETTA 2(DE3)/PET24B(+)-ROS1 — ПРОДУЦЕНТ МЕТИЛЦИТОЗИН-СПЕЦИФИЧЕСКОЙ ДНК-ГЛИКОЗИЛАЗЫ ROS1. Петрова Д.В., Жарков Д.О. Патент РФ № 2775207, приоритет от 12.07.2021.

2.МОДИФИЦИРОВАННАЯ НАПРАВЛЯЮЩАЯ РНК, ОБЛАДАЮЩАЯ СПОСОБНОСТЬЮ ИНАКТИВИРОВАТЬ СИСТЕМУ РЕДАКТИРОВАНИЯ ГЕНОМА CRISPR/CAS9, И СПОСОБ ЕЕ ПОЛУЧЕНИЯ. Новопашина Д.С., Ахметова Е.А., Мещанинова М.И., Вохтанцев И.П., Жарков Д.О., Веньяминова А.Г. Патент РФ № 2765159, приоритет от 26.08.2020.

3.БАЗА ДАННЫХ УЧЕТА БИОЛОГИЧЕСКИХ ОБРАЗЦОВ И ОПИСАНИЯ КЛИНИКО-ПАТОЛОГИЧЕСКИХ ХАРАКТЕРИСТИК ПАЦИЕНТОВ С ЗАБОЛЕВАНИЯМИ ЛЕГКОГО (БД-РЛ). Морозкин Е.С., Попов А.В., Пономарева А.А., Чердынцева Н.В., Рыкова Е.Ю., Аникеева О.Ю., Пашковская О.А., Покушалов Е.А., Лактионов П.П., Власов В.В. База данных № 2015620538, приоритет от 07.11.2014.

4.БАЗА ДАННЫХ УЧЕТА БИОЛОГИЧЕСКИХ ОБРАЗЦОВ И ОПИСАНИЯ КЛИНИКО-ПАТОЛОГИЧЕСКИХ ХАРАКТЕРИСТИК ПАЦИЕНТОВ С НОВООБРАЗОВАНИЯМИ ПРЕДСТАТЕЛЬНОЙ ЖЕЛЕЗЫ. Брызгунова О.Е., Морозкин Е.С., Попов А.В., Бондарь А.А., Тамкович С.Н., Зарипов М.М., Покушалов Е.А., Лактионов П.П. База данных № 2014620509, приоритет от 06.12.2013.

5.БАЗА ДАННЫХ УЧЕТА БИОЛОГИЧЕСКИХ ОБРАЗЦОВ ОТ ПАЦИЕНТОВ С НОВООБРАЗОВАНИЯМИ МОЛОЧНОЙ ЖЕЛЕЗЫ (УБО-НМЖ). Тамкович С.Н., Милейко В.А., Попов А.В., Власов В.В., Лактионов П.П. 2012 г. База данных № 2012621042, приоритет от 13.08.2012.

6.СРЕДСТВО ДЛЯ ИНГИБИРОВАНИЯ ФЕРМЕНТА 8-ОКСОГУАНИН-ДНК-ГЛИКОЗИЛАЗЫ ЧЕЛОВЕКА. Кузнецов Н.А., Коваль В.В., Воробьев Ю.Н., Жарков Д.О., Сильников В.Н., Федорова О.С. 2010 г. Патент РФ № 2380417, приоритет от 25.04.2008.