Научная деятельность

Основные направления деятельности Института

Секвенаторы (ЦКП «Геномика» СО РАН)
Геномный секвенатор MGIseq 2000
MGIseq 2000 (DNBseq-G400) это высокопроизводительный геномный секвенатор, позволяющий за один запуск (48 часов) получить до 1 440 Гб высококачественных данных. Возможности прибора Полногеномное секвенирование эукариот Секвенирование экзома Секвенирование транскриптома Метагеномное секвенирование В зависимости от задач можно использовать одноконцевые (SE) или парноконцевые (PE) прочтения различной длины (SE50, PE50, SE100, PE100, PE150, PE200, SE400).
Геномный секвенатор MiSeq
MiSeq - это производительный компактный геномный секвенатор, позволяющий проводить секвенирование по технологии sequencing by synthesis. Возможность использования баркодов увеличивает возможности анализа до 96 образцов. Для прибора существует большое количество наборов, позволяющих получать прочтения разной длины (36-300 нт.) и объема (0,5-15 Гб.) В центре в основном используется набор 2х300, который обеспечивает наиболее длинные прочтения и максимальный объем данных 13-15 Гб. Возможности прибора Полногеномное секвенирование бактерий и вирусов. Глубокое секвенирование ПЦР-ампликонов.
Геномный секвенатор MinIon
Oxford Nanopore
Капиллярные секвенаторы ABI 3130XL Genetic Analyser, Applied Biosystems
Сканер микрочипов iScan, Illumina.
Роботизированная раскапывающая станция, TECAN EVO 100, TECAN.
Система электрофоретического анализа нуклеиновых кислот на микрочипах, Bioanalyzer 2100, Agilent.
Система электрофоретического анализа нуклеиновых кислот на микрочипах, MCE-202 MultiNA, Shimadzu.
Электрофоретическая система для автоматического фракционирования ДНК по длине, BluePippin, Sage Science.
Прибор для фрагментации ДНК и дезагрегации микрочастиц, Covaris S2, Covaris.
Прибор для фрагментации ДНК, Hydroshear, Digilab.
Гомогенизатор, TissueLyser II, Qiagen.
ИТ-инфраструктура
Кластер Dell архитектуры Beowulf: 4 нода Dell PowerEdge 1950 (2 процессора Intel Xeon 5130, 16GB RAM); Система хранения данных SAS 24 Tb; Сервер Dell PowerEdge R820 (2 процессора Intel Xeon e5 4607, 64 Gb RAM, накопитель PCI-e SSD OCZ RM84 1.2Tb).
Хотите работать у нас?